17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0051 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0051  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00150158  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0011  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000356582  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0026  tRNA-Ser  87.14 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0562701  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0011  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0012  tRNA-Ser  97.14 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0039  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000913724  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0047  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.232524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0002  tRNA-Ser  85.14 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000210278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0002  tRNA-Ser  85.14 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0001521  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0039  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0044  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00104737  normal  0.145686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0050  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0163421  hitchhiker  0.00837665 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0008  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0066  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0635927  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>