64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_R0039 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_R0039  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000913724  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0039  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0011  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0051  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0011  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000356582  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0059  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00150158  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578587  hitchhiker  0.00382784 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6557  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0695798 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0047  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.232524  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0061  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0064  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna26  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540451  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna25  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000226123  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0045  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0027  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0051  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0027  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0851644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0035  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181882  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0022  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0012  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0058  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.345279  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2775  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0559618  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0056  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000159077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0047  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0043  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1206  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0049  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0001  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1128  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.93394e-25 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1195  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1150  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.14508  normal  0.321314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1045  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.395551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1162  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.520358 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0019  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0052  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000218477  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt03  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0026    96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0760613  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0043  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0007  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0957945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100748  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0027  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0016  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0019  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0016  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2147  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.478396 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer03  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000286931  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0041  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0042  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.760649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA21  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213698  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0021  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.846979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0046  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557666 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4663  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000383735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5026  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747875  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00023  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115823  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0065  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0269499  hitchhiker  0.0000672663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>