43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0789 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0789  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2159  hypothetical protein  42.86 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2566  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.33 
 
 		 109 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16936  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1517  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.86 
 
 		 370 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1466  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.11 
 
 		 370 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1799  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.07 
 
 		 372 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0237442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2898  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.38 
 
 		 390 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0461  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.07 
 
 		 406 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2030  2-oxoglutarate dehydrogenase, E2 component, dihydrolipoamide succinyltransferase  32 
 
 		 586 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.309812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1350  2-oxoglutarate dehydrogenase, E2 component, dihydrolipoamide succinyltransferase  29.73 
 
 		 573 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13330  2-oxoglutarate dehydrogenase E2 component  32 
 
 		 609 aa  45.1  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.218007  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3361  2-oxoglutarate dehydrogenase, E2 component, dihydrolipoamide succinyltransferase  31.51 
 
 		 630 aa  44.3  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0660708  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2816  2-oxoglutarate dehydrogenase, E2 subunit, dihydrolipoamide succinyltransferase  31.4 
 
 		 507 aa  44.3  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1519  Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase  35.44 
 
 		 436 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4031  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  28.36 
 
 		 86 aa  44.3  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0477  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.1 
 
 		 405 aa  44.3  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000178114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2656  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.7 
 
 		 392 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16440  2-oxoglutarate dehydrogenase E2 component  34.67 
 
 		 610 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.561244  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17790  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.62 
 
 		 496 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3579  dihydrolipoamide acetyltransferase  31.17 
 
 		 580 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561749  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4200  2-oxoglutarate dehydrogenase E2 component, dihydrolipoamide succinyltransferase  33.78 
 
 		 583 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0699883  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0141  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.26 
 
 		 539 aa  42.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0752  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.21 
 
 		 378 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0159837  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15460  2-oxoglutarate dehydrogenase E2 component  29.58 
 
 		 581 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0649  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.21 
 
 		 378 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.778033  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2626  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  38.18 
 
 		 79 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.26 
 
 		 369 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12243  dihydrolipoamide acetyltransferase  31.08 
 
 		 553 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.353474  normal  0.923662 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0239  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.29 
 
 		 367 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153912  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10490  2-oxoglutarate dehydrogenase E2 component  33.33 
 
 		 598 aa  42  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0858003  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3627  hypothetical protein  44.74 
 
 		 84 aa  41.6  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.794226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0345  dihydrolipoamide acetyltransferase  32.88 
 
 		 450 aa  41.6  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1606  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  32.79 
 
 		 87 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3375  dihydrolipoamide acetyltransferase  28.57 
 
 		 629 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0437306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4978  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.82 
 
 		 369 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.886427  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3313  dihydrolipoamide acetyltransferase  28.57 
 
 		 611 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.753117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3324  dihydrolipoamide acetyltransferase  28.57 
 
 		 629 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.295161 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  29.41 
 
 		 1204 aa  41.2  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2303  2-oxoglutarate dehydrogenase E2 component  32.43 
 
 		 597 aa  40.8  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2935  dihydrolipoamide acetyltransferase  28.95 
 
 		 614 aa  40.8  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1134  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  30.51 
 
 		 476 aa  40.8  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.73839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3074  2-oxoglutarate dehydrogenase, E2 component, dihydrolipoamide succinyltransferase  28.38 
 
 		 604 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0633  dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase  23.29 
 
 		 444 aa  40.4  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000982731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>