34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1622 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1622  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 112 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6446  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  31.82 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2361  hypothetical protein  33.65 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3472  type IV pilus assembly PilZ  27.88 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3408  type IV pilus assembly PilZ  27.88 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0420248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4589  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  32.5 
 
 		 239 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3328  hypothetical protein  26.92 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1598  type IV pilus assembly PilZ  32.04 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1503  type IV pilus assembly PilZ  32.04 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1508  type IV pilus assembly PilZ  32.71 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3986  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  28.57 
 
 		 236 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.694656  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0040  response regulator  32.35 
 
 		 239 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000155004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5122  type IV pilus assembly PilZ  33.06 
 
 		 843 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0427193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3745  response regulator receiver domain-containing protein  42.59 
 
 		 280 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3802  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  42.59 
 
 		 279 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0707641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0489  type IV pilus assembly PilZ  28.3 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0733  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 228 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000127746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3886  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  42.59 
 
 		 279 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1769  hypothetical protein  30.93 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.381644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3220  response regulator receiver domain-containing protein  36.51 
 
 		 233 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.975965  hitchhiker  0.00188513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0726  type IV pilus assembly PilZ  33.71 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0058  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  27.66 
 
 		 226 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000220235 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2071  type IV pilus assembly PilZ  29.9 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2163  type IV pilus assembly PilZ  29.9 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.409916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4201  response regulator receiver domain-containing protein  31.82 
 
 		 262 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4722  type IV pilus assembly PilZ  29.73 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.992615  normal  0.959626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0725  hypothetical protein  28.42 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.181529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0075  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  26.6 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.124346  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4350  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.68 
 
 		 248 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767241  normal  0.344464 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4356  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  31.82 
 
 		 248 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  26.55 
 
 		 760 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4333  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  31.82 
 
 		 248 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3263  response regulator  31.82 
 
 		 231 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1696  hypothetical protein  23.81 
 
 		 115 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>