26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0012 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  100 
 
 		 565 aa  1144    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  29.34 
 
 		 614 aa  206  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1882  hypothetical protein  25.83 
 
 		 552 aa  176  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785906 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2025  hypothetical protein  25.6 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0311  hypothetical protein  25.41 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000410606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0121  hypothetical protein  24.28 
 
 		 558 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2324  FG-GAP repeat protein  23.37 
 
 		 561 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3306  hypothetical protein  26.92 
 
 		 505 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00244316  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0197  hypothetical protein  25.51 
 
 		 555 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0939  FG-GAP repeat protein  26.93 
 
 		 568 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.659758  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3253  hypothetical protein  26.26 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000436664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0567  hypothetical protein  28.32 
 
 		 476 aa  108  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.15788e-22 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2185  hypothetical protein  26.74 
 
 		 498 aa  106  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000017001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3256  hypothetical protein  24.83 
 
 		 510 aa  103  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000373547  hitchhiker  9.15864e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0660  hypothetical protein  27.41 
 
 		 492 aa  100  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0554  hypothetical protein  26 
 
 		 476 aa  98.6  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000494552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0520  hypothetical protein  23.54 
 
 		 505 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000613286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  26.55 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  34.17 
 
 		 888 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  26.92 
 
 		 893 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.29 
 
 		 920 aa  57.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  28.38 
 
 		 896 aa  57  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.63 
 
 		 892 aa  53.9  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1261  hypothetical protein  26.73 
 
 		 506 aa  52  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000214476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.32 
 
 		 895 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.22 
 
 		 895 aa  43.5  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>