18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3253 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3253  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1039    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000436664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0520  hypothetical protein  47.58 
 
 		 505 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000613286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3256  hypothetical protein  38.72 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000373547  hitchhiker  9.15864e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3306  hypothetical protein  38.27 
 
 		 505 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00244316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0660  hypothetical protein  37.43 
 
 		 492 aa  349  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0567  hypothetical protein  35.29 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.15788e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0554  hypothetical protein  33.67 
 
 		 476 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000494552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2185  hypothetical protein  27.29 
 
 		 498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000017001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  36.04 
 
 		 376 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0939  FG-GAP repeat protein  31.88 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.659758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  26.11 
 
 		 565 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  21.32 
 
 		 614 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1882  hypothetical protein  22.2 
 
 		 552 aa  69.7  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785906 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2025  hypothetical protein  22.53 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0197  hypothetical protein  19.76 
 
 		 555 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0311  hypothetical protein  21.13 
 
 		 535 aa  62.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000410606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0121  hypothetical protein  21 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2324  FG-GAP repeat protein  19.82 
 
 		 561 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>