21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0121 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0121  hypothetical protein  100 
 
 
558 aa  1150    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2025  hypothetical protein  57.28 
 
 
554 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0197  hypothetical protein  55.83 
 
 
555 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1882  hypothetical protein  39.68 
 
 
552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0311  hypothetical protein  42.66 
 
 
535 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000410606  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2324  FG-GAP repeat protein  39.75 
 
 
561 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  25.45 
 
 
614 aa  168  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  24.53 
 
 
565 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2185  hypothetical protein  24.26 
 
 
498 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000017001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0939  FG-GAP repeat protein  22.46 
 
 
568 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.659758  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0660  hypothetical protein  22.51 
 
 
492 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3306  hypothetical protein  21.83 
 
 
505 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00244316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0567  hypothetical protein  21.66 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.15788e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  24.1 
 
 
376 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0520  hypothetical protein  23.12 
 
 
505 aa  64.3  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000613286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3253  hypothetical protein  21 
 
 
510 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000436664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3256  hypothetical protein  21.32 
 
 
510 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000373547  hitchhiker  9.15864e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0554  hypothetical protein  21.69 
 
 
476 aa  53.9  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000494552  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.56 
 
 
892 aa  48.9  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  27.2 
 
 
896 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.11 
 
 
895 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>