18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5324 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5324  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3- type  100 
 
 		 52 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00716612  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3563  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3- type  65.22 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201195  normal  0.576865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1137  hypothetical protein  57.69 
 
 		 55 aa  63.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0106882  normal  0.952365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0680  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3- type  48.08 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2483  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  54.35 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0591918 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0712  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  42.31 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720002  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2359  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.55 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98342 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0165  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.23 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5919  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48.89 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.662161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1815  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  42.31 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2415  secretion protein HlyD  42.55 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1276  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.75 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2993  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  41.67 
 
 		 69 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0462  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.92 
 
 		 52 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1814  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.58 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.69622  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1196  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.45 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1103  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.45 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0784477  normal  0.590624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2217  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>