47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1814 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1814  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  100 
 
 		 62 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.69622  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1370  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  76.6 
 
 		 54 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.938434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1575  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  61.02 
 
 		 60 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2082  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  74.47 
 
 		 63 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1178  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  49.18 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1226  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  59.26 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.012112  normal  0.558991 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1340  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  63.04 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1238  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  63.04 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1230  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.83 
 
 		 53 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1276  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.43 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3047  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.48 
 
 		 53 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0712  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  46.88 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720002  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2993  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48.98 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0165  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.48 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2415  secretion protein HlyD  40.32 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2611  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.1 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38073  normal  0.51835 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02297  hypothetical protein  45.83 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5928  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  32.2 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.657419 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2359  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  37.7 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98342 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0452  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.68 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0935391  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003473  type cbb3 cytochrome oxidase biogenesis protein CcoS involved in heme b insertion  41.67 
 
 		 54 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4955  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.62 
 
 		 52 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000981596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5919  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.662161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3323  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  40.48 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0243934  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2537  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.44 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.544754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1047  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.98 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.372201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7464  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40 
 
 		 45 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1874  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  37.1 
 
 		 77 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.308145  normal  0.762783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0933  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.71 
 
 		 70 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.177633  normal  0.669398 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1569  cytochrome oxidase maturation protein (cbb3-t)  42.86 
 
 		 56 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.246942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1791  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.73 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5324  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3- type  39.58 
 
 		 52 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00716612  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2207  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.48 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1815  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  31.67 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2220  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.48 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000072597  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4493  hypothetical protein  43.48 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3827  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2214  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.48 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365447  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2220  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.13 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.482957  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2164  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.48 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.123278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44450  hypothetical protein  37.1 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00324047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3580  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19940  cbb3-type cytochrome oxidase maturation protein  34.85 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225111  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3784  hypothetical protein  37.1 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376969  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2394  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  33.33 
 
 		 49 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4262  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1606  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0765964  normal  0.010544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>