27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0680 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0680  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3- type  100 
 
 		 71 aa  148  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1137  hypothetical protein  56.86 
 
 		 55 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0106882  normal  0.952365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5324  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3- type  48.08 
 
 		 52 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00716612  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3563  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3- type  39.13 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201195  normal  0.576865 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2483  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.94 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0591918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2359  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48.89 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1995  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  28.36 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.407314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2993  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  30.3 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0165  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  25.76 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1525  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.19 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1791  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.56 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3323  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  44.19 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0243934  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4262  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  26.87 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1606  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  26.87 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0765964  normal  0.010544 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1052  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  27.54 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1156  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.96 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.0826721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0462  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.82 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1815  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  29.82 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3580  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.78 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3827  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.78 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1874  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  33.33 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.308145  normal  0.762783 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3850  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40 
 
 		 51 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19940  cbb3-type cytochrome oxidase maturation protein  26.15 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225111  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1797  hypothetical protein  33.87 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275995  normal  0.177533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0712  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  29.82 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720002  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0577  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  51.61 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0051879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2415  secretion protein HlyD  31.34 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>