55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1137 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1137  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0106882  normal  0.952365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0680  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3- type  56.86 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5324  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3- type  57.69 
 
 		 52 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00716612  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3563  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3- type  60 
 
 		 71 aa  60.1  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201195  normal  0.576865 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2359  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  51.11 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2483  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  53.19 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0591918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0165  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.64 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1052  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.44 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0462  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  50 
 
 		 52 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2993  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  32.76 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1791  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.21 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1815  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  40.38 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2082  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1370  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  42.22 
 
 		 54 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.938434  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19940  cbb3-type cytochrome oxidase maturation protein  40.38 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2415  secretion protein HlyD  42.59 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1995  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  41.67 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.407314  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1156  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.44 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.0826721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3323  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  44.19 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0243934  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1874  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.43 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.308145  normal  0.762783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1196  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.36 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1103  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.36 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0784477  normal  0.590624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2611  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.44 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38073  normal  0.51835 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1364  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  41.82 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.540828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3580  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.85 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0712  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  33.33 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720002  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3827  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4262  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.85 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2256  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.22 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0217106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1178  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.44 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3850  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.1 
 
 		 51 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2394  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  48.89 
 
 		 49 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7464  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.44 
 
 		 45 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1276  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1606  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.85 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0765964  normal  0.010544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1275  signal peptide protein  32.73 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44450  hypothetical protein  40.38 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00324047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5919  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.22 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.662161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2419  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.55 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00562529  hitchhiker  0.0000013889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3784  hypothetical protein  40.38 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376969  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0541  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.23 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2220  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  33.33 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.482957  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1525  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.53 
 
 		 55 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1226  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.012112  normal  0.558991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1845  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.85 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224574  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5023  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 52 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0344  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  36.21 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00994318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1991  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  33.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0668  nitrogen fixation protein fixS  46.15 
 
 		 52 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1340  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.22 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1238  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.22 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2042  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  35.56 
 
 		 48 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.589343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2045  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  37.78 
 
 		 48 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00305022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4955  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 52 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000981596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1569  cytochrome oxidase maturation protein (cbb3-t)  32.73 
 
 		 56 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.246942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>