More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3375 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3375  para-aminobenzoate synthase component I  100 
 
 
334 aa  694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0129  para-aminobenzoate synthase component I  46.79 
 
 
335 aa  309  4e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.98065  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0462  para-aminobenzoate synthase component I  47.3 
 
 
312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000026436  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1638  Chorismate binding-like protein  47.02 
 
 
320 aa  301  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1949  para-aminobenzoate synthase component I  45.57 
 
 
338 aa  293  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0510946 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1098  para-aminobenzoate synthase component I  45.54 
 
 
305 aa  259  4e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154491  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1311  para-aminobenzoate synthase component I  48.12 
 
 
308 aa  248  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000482298  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.14 
 
 
470 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  34.44 
 
 
467 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.11 
 
 
470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  30.82 
 
 
466 aa  126  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.75 
 
 
470 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1696  Chorismate binding-like protein  31.3 
 
 
456 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  34.75 
 
 
467 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.44 
 
 
470 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.88 
 
 
452 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  34.63 
 
 
468 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0066  Anthranilate synthase  35.8 
 
 
473 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  31.58 
 
 
458 aa  122  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  33.2 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0493  anthranilate synthase component I  28.95 
 
 
495 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  34.33 
 
 
467 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1246  anthranilate synthase component I  38.03 
 
 
492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1213  anthranilate synthase  31.32 
 
 
492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.36 
 
 
509 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  34.5 
 
 
495 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0068  para-aminobenzoate synthase component I  31.66 
 
 
465 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0064  para-aminobenzoate synthase component I  31.66 
 
 
465 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0064  para-aminobenzoate synthase component I  31.66 
 
 
465 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0076  para-aminobenzoate synthase, component I  28.74 
 
 
465 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0068  para-aminobenzoate synthase component I  31.66 
 
 
465 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0077  para-aminobenzoate synthase, component I  31.66 
 
 
465 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000409192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2137  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  30.63 
 
 
428 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0080  para-aminobenzoate synthase, component I  31.66 
 
 
465 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0067  para-aminobenzoate synthase component I  31.66 
 
 
480 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3368  anthranilate synthase component I  35.17 
 
 
493 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.082923  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.12 
 
 
629 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04195  anthranilate synthase component I  28.82 
 
 
491 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2351  chorismate binding-like protein  33.45 
 
 
500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181309  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1468  anthranilate synthase component I  32.65 
 
 
496 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.408149  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0228  anthranilate synthase  35.14 
 
 
515 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  32.82 
 
 
471 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0984  para-aminobenzoate synthase component I, ADC synthase  32.16 
 
 
582 aa  117  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  31.46 
 
 
456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  31 
 
 
450 aa  116  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2940  anthranilate synthase component I  33.59 
 
 
471 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.256099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.82 
 
 
461 aa  116  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  33.59 
 
 
454 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.7 
 
 
469 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2480  para-aminobenzoate synthase component I  32.18 
 
 
512 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0506  anthranilate synthase component I  35.48 
 
 
505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  31.21 
 
 
496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2227  anthranilate synthase component I  37.24 
 
 
520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4378  anthranilate synthase component I  35.89 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09868  para-aminobenzoate synthase, component I  33.2 
 
 
430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3169  anthranilate synthase component I  36.36 
 
 
502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276011  normal  0.09914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  32.86 
 
 
465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3481  anthranilate synthase component I  30.5 
 
 
491 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  33.07 
 
 
465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0411  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.58 
 
 
434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2133  Anthranilate synthase  35.57 
 
 
484 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1117  anthranilate synthase component I  32.66 
 
 
468 aa  114  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4701  para-aminobenzoate synthase component I  32.06 
 
 
503 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  33.2 
 
 
454 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5240  para-aminobenzoate synthase, component I  32.41 
 
 
465 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1277  anthranilate synthase  36.15 
 
 
467 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.315309  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  31.92 
 
 
453 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  31.71 
 
 
460 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1366  para-aminobenzoate synthase component I  33.33 
 
 
537 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5118  anthranilate synthase component I  32.95 
 
 
492 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3245  anthranilate synthase component I  31.2 
 
 
505 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0376  anthranilate synthase component I  31.84 
 
 
493 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957074  normal  0.0417216 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2846  anthranilate synthase component I  31.2 
 
 
505 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361965  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1822  Anthranilate synthase  36.49 
 
 
469 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.06 
 
 
480 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.62 
 
 
721 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2225  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.05 
 
 
476 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  32.68 
 
 
430 aa  113  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  33.07 
 
 
430 aa  112  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  31.06 
 
 
462 aa  113  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3579  anthranilate synthase component I  32.95 
 
 
574 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736027  normal  0.0487715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0568  anthranilate synthase, component I  32.2 
 
 
493 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0747  anthranilate synthase, component I  33.81 
 
 
493 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3213  anthranilate synthase component I  35.71 
 
 
488 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0493446  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.31 
 
 
473 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  33.2 
 
 
454 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  35.63 
 
 
731 aa  112  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.2 
 
 
456 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1684  anthranilate synthase, component I  35 
 
 
528 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102471  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.95 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2109  anthranilate synthase component I  30.71 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4609  anthranilate synthase component I  32.2 
 
 
493 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.92 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  33.85 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.95 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3618  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  32.58 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  32.21 
 
 
507 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1251  anthranilate/para-aminobenzoate synthass component I  32.58 
 
 
485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2621  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  31.95 
 
 
523 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260936  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  33.2 
 
 
454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>