90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1346 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0130  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  73.16 
 
 
524 aa  741    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.713091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5236  putative microcystin LR degradation protein MlrC  74.62 
 
 
519 aa  787    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.781031  hitchhiker  0.000000241769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1346  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  100 
 
 
523 aa  1065    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4051  Microcystin LR degradation protein MlrC  53.63 
 
 
524 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4334  MlrC domain-containing protein  46.76 
 
 
489 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67984  normal  0.0960828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4776  MlrC domain-containing protein  45.09 
 
 
489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76631  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00790  hypothetical protein  43.71 
 
 
509 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1717  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  44.26 
 
 
482 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679786  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4101  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  40.25 
 
 
480 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3778  MlrC domain protein  39.63 
 
 
488 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6252  hypothetical protein  38.99 
 
 
488 aa  339  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.179737  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4654  MlrC domain-containing protein  37.87 
 
 
477 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  0.119732 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1696  hypothetical protein  29.9 
 
 
493 aa  208  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5087  hypothetical protein  28.66 
 
 
482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00418234  normal  0.445331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3711  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  29.64 
 
 
482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21787  hitchhiker  0.00970232 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1557  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  27.7 
 
 
483 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1221  MlrC-like protein  28.85 
 
 
515 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1621  hypothetical protein  27.57 
 
 
491 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0947431  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1194  MlrC-like  28.09 
 
 
506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1868  hypothetical protein  28.6 
 
 
491 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1322  MlrC-like  27.62 
 
 
502 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6568  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  27.45 
 
 
496 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102219  hitchhiker  0.00991258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2627  MlrC domain-containing protein  29.56 
 
 
503 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1343  hypothetical protein  28.86 
 
 
503 aa  160  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99178  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5513  hypothetical protein  27.93 
 
 
500 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142983  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3464  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  27.2 
 
 
488 aa  158  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1406  MlrC domain protein  28.74 
 
 
501 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513277  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4633  hypothetical protein  28.6 
 
 
500 aa  157  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0253146  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4481  hypothetical protein  27.04 
 
 
497 aa  156  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313264  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0684  hypothetical protein  28.43 
 
 
491 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2560  hypothetical protein  28.2 
 
 
496 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6004  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.03 
 
 
498 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6696  MlrC domain-containing protein  27.03 
 
 
516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380742  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5859  MlrC domain-containing protein  27.8 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0807432  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2751  hypothetical protein  27.79 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00233785  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0874  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.17 
 
 
487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4902  MlrC domain protein  27.04 
 
 
492 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3885  hypothetical protein  27.71 
 
 
498 aa  148  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3825  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  27.04 
 
 
492 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0702  hypothetical protein  26.71 
 
 
489 aa  147  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6029  MlrC domain-containing protein  26.85 
 
 
488 aa  147  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02129  hypothetical protein  26.45 
 
 
494 aa  146  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1587  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  26.8 
 
 
490 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1369  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  27.74 
 
 
487 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0897  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.25 
 
 
490 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4155  MlrC domain-containing protein  27.31 
 
 
498 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.870407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3013  MlrC domain-containing protein  27.09 
 
 
515 aa  144  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.784284 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0752  hypothetical protein  26.51 
 
 
489 aa  144  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.256842  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4266  MlrC domain-containing protein  25.3 
 
 
494 aa  143  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1296  MlrC C-terminus family protein  27.04 
 
 
502 aa  143  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2942  MlrC domain-containing protein  27.04 
 
 
511 aa  143  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3571  Microcystin LR degradation protein MlrC  25 
 
 
488 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105473 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3899  hypothetical protein  25.85 
 
 
489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5259  hypothetical protein  26.55 
 
 
508 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  0.119677 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4364  MlrC domain-containing protein  24.85 
 
 
527 aa  140  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4756  MlrC domain-containing protein  28.34 
 
 
491 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3815  MlrC-like  27.73 
 
 
500 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0503052 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3102  MlrC domain-containing protein  26.02 
 
 
518 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328821  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2977  MlrC domain-containing protein  26.35 
 
 
512 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1326  MlrC C-terminus family protein  26.02 
 
 
518 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4259  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  27 
 
 
494 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6097  MlrC domain-containing protein  27.42 
 
 
500 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6625  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  25.64 
 
 
491 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0548728  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7545  hypothetical protein  27.15 
 
 
500 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7649  MlrC domain-containing protein  27.38 
 
 
498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428726  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6086  MlrC domain-containing protein  27 
 
 
500 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3774  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.51 
 
 
510 aa  133  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2285  MlrC C-terminus family protein  25.88 
 
 
512 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.887677  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3068  MlrC domain-containing protein  26.88 
 
 
511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0762  MlrC domain-containing protein  28.32 
 
 
495 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5682  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  24.7 
 
 
491 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0397  MlrC-like  25.35 
 
 
499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4349  hypothetical protein  27.27 
 
 
488 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2255  MlrC C-terminus family protein  27.79 
 
 
525 aa  128  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4648  hypothetical protein  24.71 
 
 
497 aa  124  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.0618812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3378  MlrC domain-containing protein  30.65 
 
 
515 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0192331  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6569  MlrC domain-containing protein  26.45 
 
 
492 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0911835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6174  MlrC domain protein  24.8 
 
 
505 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1929  MlrC domain-containing protein  24.06 
 
 
507 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1660  hypothetical protein  25.31 
 
 
552 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3062  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  26.81 
 
 
500 aa  120  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954396  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1459  Microcystin LR degradation protein MlrC  25.66 
 
 
498 aa  120  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6244  hypothetical protein  23.76 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5722  MlrC-like  27.32 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3979  MlrC-like  24.38 
 
 
494 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1428  hypothetical protein  23.91 
 
 
510 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3799  MlrC domain-containing protein  23.77 
 
 
499 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6012  MlrC domain-containing protein  24.25 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1258  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  24.79 
 
 
561 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.367829  normal  0.015953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  31.43 
 
 
668 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>