90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1557 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1868  hypothetical protein  65.7 
 
 
491 aa  657    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1621  hypothetical protein  62.94 
 
 
491 aa  648    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0947431  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1557  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  100 
 
 
483 aa  981    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5087  hypothetical protein  81.84 
 
 
482 aa  816    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00418234  normal  0.445331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3711  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  61.17 
 
 
482 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21787  hitchhiker  0.00970232 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4349  hypothetical protein  51.75 
 
 
488 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0752  hypothetical protein  48.55 
 
 
489 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.256842  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0702  hypothetical protein  48.55 
 
 
489 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0897  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  49.79 
 
 
490 aa  445  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1369  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  50.83 
 
 
487 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504048  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3899  hypothetical protein  47.63 
 
 
489 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0874  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  51.67 
 
 
487 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6625  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  46.38 
 
 
491 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0548728  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5682  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  46.38 
 
 
491 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4648  hypothetical protein  46.58 
 
 
497 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.0618812 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2751  hypothetical protein  42.8 
 
 
488 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00233785  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4633  hypothetical protein  44.74 
 
 
500 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0253146  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6244  hypothetical protein  45.61 
 
 
434 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0684  hypothetical protein  42.39 
 
 
491 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1428  hypothetical protein  41.91 
 
 
510 aa  356  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1343  hypothetical protein  34.62 
 
 
503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99178  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5513  hypothetical protein  31.53 
 
 
500 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3815  MlrC-like  32.87 
 
 
500 aa  209  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0503052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2627  MlrC domain-containing protein  31.9 
 
 
503 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1322  MlrC-like  30.44 
 
 
502 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4364  MlrC domain-containing protein  28.46 
 
 
527 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02129  hypothetical protein  31.89 
 
 
494 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1406  MlrC domain protein  31.03 
 
 
501 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513277  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1221  MlrC-like protein  30.97 
 
 
515 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4481  hypothetical protein  30.5 
 
 
497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313264  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3013  MlrC domain-containing protein  30.92 
 
 
515 aa  195  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.784284 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2942  MlrC domain-containing protein  30.8 
 
 
511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1296  MlrC C-terminus family protein  30.8 
 
 
502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3825  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  32.53 
 
 
492 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4902  MlrC domain protein  32.53 
 
 
492 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6004  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.08 
 
 
498 aa  190  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3774  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.16 
 
 
510 aa  190  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1194  MlrC-like  31.22 
 
 
506 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1587  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  32.14 
 
 
490 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5259  hypothetical protein  29.96 
 
 
508 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  0.119677 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6174  MlrC domain protein  31.21 
 
 
505 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7649  MlrC domain-containing protein  31.49 
 
 
498 aa  183  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428726  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6252  hypothetical protein  28.95 
 
 
488 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.179737  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3464  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.6 
 
 
488 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6568  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.66 
 
 
496 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102219  hitchhiker  0.00991258 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3378  MlrC domain-containing protein  33.06 
 
 
515 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0192331  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6696  MlrC domain-containing protein  32.92 
 
 
516 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380742  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3068  MlrC domain-containing protein  31.29 
 
 
511 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295091  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4756  MlrC domain-containing protein  30.63 
 
 
491 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5859  MlrC domain-containing protein  29.32 
 
 
500 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0807432  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2255  MlrC C-terminus family protein  30.39 
 
 
525 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3571  Microcystin LR degradation protein MlrC  26.95 
 
 
488 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1346  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.05 
 
 
523 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6029  MlrC domain-containing protein  29.08 
 
 
488 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4259  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.93 
 
 
494 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4334  MlrC domain-containing protein  30.37 
 
 
489 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67984  normal  0.0960828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4776  MlrC domain-containing protein  31.07 
 
 
489 aa  166  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76631  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2560  hypothetical protein  29.18 
 
 
496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4266  MlrC domain-containing protein  28.89 
 
 
494 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4101  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  26.6 
 
 
480 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4654  MlrC domain-containing protein  29.05 
 
 
477 aa  163  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  0.119732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00790  hypothetical protein  27.86 
 
 
509 aa  163  7e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1660  hypothetical protein  26.75 
 
 
552 aa  163  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7545  hypothetical protein  29.38 
 
 
500 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0130  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  27.16 
 
 
524 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.713091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5236  putative microcystin LR degradation protein MlrC  28.19 
 
 
519 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.781031  hitchhiker  0.000000241769 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6086  MlrC domain-containing protein  30.38 
 
 
500 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3778  MlrC domain protein  25.98 
 
 
488 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6097  MlrC domain-containing protein  30.32 
 
 
500 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2285  MlrC C-terminus family protein  29.56 
 
 
512 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.887677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0397  MlrC-like  29.27 
 
 
499 aa  157  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3979  MlrC-like  27.44 
 
 
494 aa  156  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1696  hypothetical protein  27.15 
 
 
493 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1326  MlrC C-terminus family protein  29.5 
 
 
518 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0762  MlrC domain-containing protein  27.79 
 
 
495 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2977  MlrC domain-containing protein  29.5 
 
 
512 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3102  MlrC domain-containing protein  29.5 
 
 
518 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1929  MlrC domain-containing protein  26.25 
 
 
507 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6569  MlrC domain-containing protein  29.38 
 
 
492 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0911835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4051  Microcystin LR degradation protein MlrC  29.82 
 
 
524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4155  MlrC domain-containing protein  27.94 
 
 
498 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.870407 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3885  hypothetical protein  27.94 
 
 
498 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5722  MlrC-like  29.49 
 
 
403 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1459  Microcystin LR degradation protein MlrC  28.54 
 
 
498 aa  128  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1717  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.77 
 
 
482 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679786  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3799  MlrC domain-containing protein  26.85 
 
 
499 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3062  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  27 
 
 
500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954396  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1258  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  29.22 
 
 
561 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.367829  normal  0.015953 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6012  MlrC domain-containing protein  27.15 
 
 
376 aa  100  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6013  hypothetical protein  30.37 
 
 
143 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>