90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5087 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1868  hypothetical protein  69.23 
 
 		 491 aa  674    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1557  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  81.84 
 
 		 483 aa  816    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1621  hypothetical protein  64.05 
 
 		 491 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0947431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5087  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  974    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00418234  normal  0.445331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3711  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  62 
 
 		 482 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21787  hitchhiker  0.00970232 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0702  hypothetical protein  48.97 
 
 		 489 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104347  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0752  hypothetical protein  48.76 
 
 		 489 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.256842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4349  hypothetical protein  50.52 
 
 		 488 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0897  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  51.04 
 
 		 490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3899  hypothetical protein  47.93 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0874  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  51.14 
 
 		 487 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4648  hypothetical protein  46.57 
 
 		 497 aa  428  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.0618812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1369  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  50.72 
 
 		 487 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504048  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6625  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  46.36 
 
 		 491 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0548728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5682  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  45.32 
 
 		 491 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2751  hypothetical protein  44.35 
 
 		 488 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00233785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4633  hypothetical protein  45.15 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0253146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6244  hypothetical protein  47.51 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0684  hypothetical protein  44.49 
 
 		 491 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1428  hypothetical protein  44.51 
 
 		 510 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5513  hypothetical protein  32.46 
 
 		 500 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142983  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4364  MlrC domain-containing protein  30.65 
 
 		 527 aa  215  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1343  hypothetical protein  33.94 
 
 		 503 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1322  MlrC-like  30.72 
 
 		 502 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1221  MlrC-like protein  31.61 
 
 		 515 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1406  MlrC domain protein  32.66 
 
 		 501 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513277  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02129  hypothetical protein  33.54 
 
 		 494 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2627  MlrC domain-containing protein  32.38 
 
 		 503 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4481  hypothetical protein  30.71 
 
 		 497 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313264  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2942  MlrC domain-containing protein  33.93 
 
 		 511 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1296  MlrC C-terminus family protein  33.93 
 
 		 502 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3815  MlrC-like  31.26 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0503052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1587  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.94 
 
 		 490 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3774  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.31 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6174  MlrC domain protein  32.2 
 
 		 505 aa  186  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3378  MlrC domain-containing protein  35.17 
 
 		 515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0192331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6004  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.44 
 
 		 498 aa  185  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4902  MlrC domain protein  32.93 
 
 		 492 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3825  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  32.93 
 
 		 492 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3013  MlrC domain-containing protein  31.01 
 
 		 515 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784284 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6568  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.04 
 
 		 496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102219  hitchhiker  0.00991258 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7649  MlrC domain-containing protein  32.59 
 
 		 498 aa  183  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6696  MlrC domain-containing protein  33.4 
 
 		 516 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6252  hypothetical protein  30.14 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.179737  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1194  MlrC-like  31.27 
 
 		 506 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1346  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  29.01 
 
 		 523 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3068  MlrC domain-containing protein  33.73 
 
 		 511 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295091  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5259  hypothetical protein  32.05 
 
 		 508 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  0.119677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4259  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.47 
 
 		 494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4756  MlrC domain-containing protein  31.04 
 
 		 491 aa  173  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4101  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.27 
 
 		 480 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3464  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31 
 
 		 488 aa  172  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2255  MlrC C-terminus family protein  33.33 
 
 		 525 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4776  MlrC domain-containing protein  32.01 
 
 		 489 aa  170  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76631  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3571  Microcystin LR degradation protein MlrC  27.78 
 
 		 488 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105473 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4654  MlrC domain-containing protein  28.78 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  0.119732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4334  MlrC domain-containing protein  30.61 
 
 		 489 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67984  normal  0.0960828 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5859  MlrC domain-containing protein  28.63 
 
 		 500 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0807432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0130  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  27.82 
 
 		 524 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.713091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2560  hypothetical protein  30 
 
 		 496 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6086  MlrC domain-containing protein  29.88 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3778  MlrC domain protein  28.85 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00790  hypothetical protein  29.94 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4266  MlrC domain-containing protein  28.74 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6029  MlrC domain-containing protein  29.4 
 
 		 488 aa  161  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1660  hypothetical protein  28.54 
 
 		 552 aa  159  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6097  MlrC domain-containing protein  29.82 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5236  putative microcystin LR degradation protein MlrC  27.16 
 
 		 519 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.781031  hitchhiker  0.000000241769 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3102  MlrC domain-containing protein  30.83 
 
 		 518 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328821  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2977  MlrC domain-containing protein  30.83 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1326  MlrC C-terminus family protein  30.83 
 
 		 518 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2285  MlrC C-terminus family protein  30.75 
 
 		 512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.887677  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1929  MlrC domain-containing protein  27.24 
 
 		 507 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7545  hypothetical protein  28.66 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0397  MlrC-like  31.6 
 
 		 499 aa  154  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0762  MlrC domain-containing protein  30.78 
 
 		 495 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1696  hypothetical protein  25.95 
 
 		 493 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4051  Microcystin LR degradation protein MlrC  31.82 
 
 		 524 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4155  MlrC domain-containing protein  29.08 
 
 		 498 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.870407 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3885  hypothetical protein  29.08 
 
 		 498 aa  150  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3979  MlrC-like  28.64 
 
 		 494 aa  148  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6569  MlrC domain-containing protein  29.07 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0911835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1717  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.63 
 
 		 482 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679786  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1459  Microcystin LR degradation protein MlrC  29.92 
 
 		 498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5722  MlrC-like  29.16 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3062  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  29.02 
 
 		 500 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3799  MlrC domain-containing protein  27.58 
 
 		 499 aa  109  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1258  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  29.76 
 
 		 561 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.367829  normal  0.015953 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6012  MlrC domain-containing protein  26.24 
 
 		 376 aa  97.4  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6013  hypothetical protein  35.29 
 
 		 143 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>