90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1406 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1406  MlrC domain protein  100 
 
 
501 aa  1015    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5259  hypothetical protein  75.6 
 
 
508 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  0.119677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1322  MlrC-like  85.69 
 
 
502 aa  859    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1221  MlrC-like protein  88.02 
 
 
515 aa  886    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1194  MlrC-like  74.85 
 
 
506 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1343  hypothetical protein  63.03 
 
 
503 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99178  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6174  MlrC domain protein  56.36 
 
 
505 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02129  hypothetical protein  55.67 
 
 
494 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6696  MlrC domain-containing protein  53.94 
 
 
516 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380742  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1296  MlrC C-terminus family protein  54.58 
 
 
502 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2942  MlrC domain-containing protein  54.58 
 
 
511 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3013  MlrC domain-containing protein  53.69 
 
 
515 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.784284 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7649  MlrC domain-containing protein  54.42 
 
 
498 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428726  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2255  MlrC C-terminus family protein  54.45 
 
 
525 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3068  MlrC domain-containing protein  54.38 
 
 
511 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295091  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3378  MlrC domain-containing protein  55.04 
 
 
515 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0192331  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2977  MlrC domain-containing protein  49.7 
 
 
512 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3102  MlrC domain-containing protein  49.5 
 
 
518 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328821  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1326  MlrC C-terminus family protein  49.5 
 
 
518 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2285  MlrC C-terminus family protein  48.69 
 
 
512 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.887677  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3815  MlrC-like  45 
 
 
500 aa  388  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0503052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0397  MlrC-like  42.17 
 
 
499 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3464  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  32.72 
 
 
488 aa  256  9e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5513  hypothetical protein  33.74 
 
 
500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142983  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6029  MlrC domain-containing protein  32.04 
 
 
488 aa  249  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3774  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  35.23 
 
 
510 aa  244  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7545  hypothetical protein  33.81 
 
 
500 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6568  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  32.52 
 
 
496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102219  hitchhiker  0.00991258 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4364  MlrC domain-containing protein  30.14 
 
 
527 aa  234  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6086  MlrC domain-containing protein  34.63 
 
 
500 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5859  MlrC domain-containing protein  34.02 
 
 
500 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0807432  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1369  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  33.88 
 
 
487 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504048  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2560  hypothetical protein  32.65 
 
 
496 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5087  hypothetical protein  33.27 
 
 
482 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00418234  normal  0.445331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3711  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  32.99 
 
 
482 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21787  hitchhiker  0.00970232 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6097  MlrC domain-containing protein  34.63 
 
 
500 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6004  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  33.2 
 
 
498 aa  226  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1587  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.69 
 
 
490 aa  226  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0897  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  33.06 
 
 
490 aa  223  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1557  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.03 
 
 
483 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4481  hypothetical protein  30.99 
 
 
497 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313264  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6569  MlrC domain-containing protein  33.88 
 
 
492 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0911835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2627  MlrC domain-containing protein  34.69 
 
 
503 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1621  hypothetical protein  30.53 
 
 
491 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0947431  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0874  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  32.65 
 
 
487 aa  217  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1868  hypothetical protein  32.32 
 
 
491 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0684  hypothetical protein  33.2 
 
 
491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4259  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  34.53 
 
 
494 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4349  hypothetical protein  32.42 
 
 
488 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4902  MlrC domain protein  30.65 
 
 
492 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3825  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.65 
 
 
492 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0702  hypothetical protein  29.6 
 
 
489 aa  210  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104347  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4756  MlrC domain-containing protein  31.54 
 
 
491 aa  209  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1660  hypothetical protein  30.19 
 
 
552 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0752  hypothetical protein  29.4 
 
 
489 aa  208  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.256842  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3899  hypothetical protein  29.92 
 
 
489 aa  206  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2751  hypothetical protein  30.54 
 
 
488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00233785  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3979  MlrC-like  29.42 
 
 
494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0762  MlrC domain-containing protein  34.55 
 
 
495 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6625  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.39 
 
 
491 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0548728  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4266  MlrC domain-containing protein  30.18 
 
 
494 aa  197  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4633  hypothetical protein  32.19 
 
 
500 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0253146  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6252  hypothetical protein  30.66 
 
 
488 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.179737  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5722  MlrC-like  35.34 
 
 
403 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4648  hypothetical protein  30.6 
 
 
497 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.0618812 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6244  hypothetical protein  30.91 
 
 
434 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1428  hypothetical protein  31.6 
 
 
510 aa  183  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4334  MlrC domain-containing protein  28.83 
 
 
489 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67984  normal  0.0960828 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5682  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  29.11 
 
 
491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3799  MlrC domain-containing protein  31.07 
 
 
499 aa  180  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4654  MlrC domain-containing protein  30 
 
 
477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  0.119732 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4155  MlrC domain-containing protein  30.93 
 
 
498 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.870407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4776  MlrC domain-containing protein  28.63 
 
 
489 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76631  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3885  hypothetical protein  30.52 
 
 
498 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6012  MlrC domain-containing protein  32.49 
 
 
376 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3571  Microcystin LR degradation protein MlrC  28.11 
 
 
488 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1346  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.54 
 
 
523 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4101  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  26.86 
 
 
480 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0130  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.71 
 
 
524 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.713091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3778  MlrC domain protein  27.31 
 
 
488 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1929  MlrC domain-containing protein  29.16 
 
 
507 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00790  hypothetical protein  27.73 
 
 
509 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1258  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.94 
 
 
561 aa  150  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.367829  normal  0.015953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1717  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.48 
 
 
482 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679786  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1696  hypothetical protein  26.39 
 
 
493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1459  Microcystin LR degradation protein MlrC  31.91 
 
 
498 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4051  Microcystin LR degradation protein MlrC  28.46 
 
 
524 aa  133  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5236  putative microcystin LR degradation protein MlrC  25.85 
 
 
519 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.781031  hitchhiker  0.000000241769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3062  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.32 
 
 
500 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954396  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6013  hypothetical protein  33.61 
 
 
143 aa  53.5  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>