11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1996 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1996  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1669 aa  3250    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.357801  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0501  outer membrane autotransporter  31.02 
 
 		 1371 aa  257  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.419631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  25 
 
 		 986 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  24.6 
 
 		 995 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  24.38 
 
 		 763 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  21.37 
 
 		 985 aa  54.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  22.98 
 
 		 488 aa  52  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  22.09 
 
 		 994 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  23.56 
 
 		 1028 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  25.09 
 
 		 3506 aa  49.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  22.54 
 
 		 759 aa  49.3  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
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