11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0121 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0121  Radical SAM domain protein  100 
 
 
381 aa  803    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  25.79 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  20.16 
 
 
332 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.02 
 
 
372 aa  47.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  26.44 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  18.03 
 
 
331 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1348  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 
322 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 
434 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0404  Radical SAM domain protein  24 
 
 
458 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.23971 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  21.79 
 
 
373 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  18.33 
 
 
354 aa  42.7  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>