45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1466 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1466  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.478313  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0368  hypothetical protein  49.18 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0224  putative transmembrane protein  47.54 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.508917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0475  hypothetical protein  40.32 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0451  hypothetical protein  40.32 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0188  putative transmembrane protein  49.18 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0243  hypothetical protein  45.9 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0138719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04024  hypothetical protein  42.65 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2854  putative transmembrane protein  45.31 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.23375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0331  hypothetical protein  51.06 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.544254  decreased coverage  0.009055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3531  putative transmembrane protein  43.08 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0315  hypothetical protein  44.12 
 
 		 72 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172325 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1640  hypothetical protein  46.77 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0343284  normal  0.981714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0146  hypothetical protein  47.46 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6171  hypothetical protein  41.67 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6263  hypothetical protein  44.26 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.461612 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6549  hypothetical protein  48.98 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1935  hypothetical protein  42.62 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.452225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2855  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0513  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1428  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0266  hypothetical protein  44.83 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.964939 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0164  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3192  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0495  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0431  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6167  hypothetical protein  39.34 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.087743  normal  0.0288472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0319  transmembrane protein  43.1 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0678  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321937  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7067  hypothetical protein  39.34 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368637  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0550  hypothetical protein  38.33 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0282  hypothetical protein  38.33 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1250  putative transmembrane protein  39.34 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2852  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0121  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932988  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4166  hypothetical protein  38.33 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1270  hypothetical protein  39.34 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2841  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.353606  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6561  hypothetical protein  39.34 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0126  hypothetical protein  38.1 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.831576 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0462  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0808424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0123  hypothetical protein  46.67 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2758  hypothetical protein  38.33 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3006  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.761715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0075  hypothetical protein  42.37 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>