45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0368 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0368  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0224  putative transmembrane protein  89.86 
 
 		 69 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.508917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0243  hypothetical protein  86.96 
 
 		 69 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0138719 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0164  hypothetical protein  63.77 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2855  hypothetical protein  63.77 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0513  hypothetical protein  63.77 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0495  hypothetical protein  63.77 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1428  hypothetical protein  63.77 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0431  hypothetical protein  63.77 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3192  hypothetical protein  63.77 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0678  hypothetical protein  63.77 
 
 		 161 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321937  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0462  hypothetical protein  62.32 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0808424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2758  hypothetical protein  60.87 
 
 		 69 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0319  transmembrane protein  61.76 
 
 		 69 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6171  hypothetical protein  59.42 
 
 		 69 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4166  hypothetical protein  62.32 
 
 		 69 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0282  hypothetical protein  60.87 
 
 		 69 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0550  hypothetical protein  62.32 
 
 		 69 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0266  hypothetical protein  62.12 
 
 		 69 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.964939 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2841  hypothetical protein  59.42 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.353606  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2852  hypothetical protein  59.42 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1640  hypothetical protein  51.47 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0343284  normal  0.981714 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1935  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.452225  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6263  hypothetical protein  54.55 
 
 		 70 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.461612 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6549  hypothetical protein  54.55 
 
 		 70 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7067  hypothetical protein  47.76 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368637  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6167  hypothetical protein  47.76 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.087743  normal  0.0288472 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6561  hypothetical protein  47.76 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1270  hypothetical protein  47.76 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3531  putative transmembrane protein  52.86 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2854  putative transmembrane protein  52.86 
 
 		 74 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.23375  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0883  putative transmembrane protein  46.58 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1250  putative transmembrane protein  46.58 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342976  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0475  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0451  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1680  putative transmembrane protein  43.75 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4386  putative transmembrane protein  41.1 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1685  hypothetical protein  46.58 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.386414  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0188  putative transmembrane protein  45 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1466  hypothetical protein  56 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.478313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0331  hypothetical protein  46.15 
 
 		 82 aa  52.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.544254  decreased coverage  0.009055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1384  putative transmembrane protein  43.06 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.074752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0315  hypothetical protein  37.88 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04024  hypothetical protein  37.14 
 
 		 72 aa  50.1  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3824  hypothetical protein  48.57 
 
 		 37 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.620418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>