13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0121 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0121  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932988  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0123  hypothetical protein  98.51 
 
 		 67 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0126  hypothetical protein  92.54 
 
 		 67 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.831576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0075  hypothetical protein  74.63 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0146  hypothetical protein  73.13 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0184  hypothetical protein  64.18 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01330  hypothetical protein  67.16 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861282  normal  0.982604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00980  hypothetical protein  65.15 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0040  DNA polymerase A  47.06 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.105525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0066  hypothetical protein  53.66 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0475  hypothetical protein  42.37 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0451  hypothetical protein  42.37 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0188  putative transmembrane protein  42.59 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>