16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0184 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0184  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0146  hypothetical protein  73.13 
 
 
67 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01330  hypothetical protein  97.1 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861282  normal  0.982604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0075  hypothetical protein  68.66 
 
 
67 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356235  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0121  hypothetical protein  64.18 
 
 
67 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932988  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0123  hypothetical protein  62.69 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0126  hypothetical protein  59.7 
 
 
67 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.831576 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0066  hypothetical protein  57.38 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00980  hypothetical protein  69.7 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0040  DNA polymerase A  43.66 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.105525  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0188  putative transmembrane protein  46.55 
 
 
63 aa  50.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04024  hypothetical protein  38.33 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0475  hypothetical protein  32.26 
 
 
67 aa  42  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0451  hypothetical protein  32.26 
 
 
67 aa  42  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1466  hypothetical protein  44.44 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.478313  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0331  hypothetical protein  45.45 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.544254  decreased coverage  0.009055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>