43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04024 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04024  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0315  hypothetical protein  80.28 
 
 		 72 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172325 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0475  hypothetical protein  39.68 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0451  hypothetical protein  39.68 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1640  hypothetical protein  43.55 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0343284  normal  0.981714 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2852  hypothetical protein  39.39 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2841  hypothetical protein  39.39 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.353606  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2758  hypothetical protein  39.39 
 
 		 69 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6171  hypothetical protein  39.39 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0462  hypothetical protein  37.88 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0808424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0188  putative transmembrane protein  46.55 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0224  putative transmembrane protein  34.85 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.508917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3043  hypothetical protein  43.55 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00029722  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0331  hypothetical protein  49.02 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.544254  decreased coverage  0.009055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0319  transmembrane protein  34.85 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0243  hypothetical protein  34.85 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0138719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0368  hypothetical protein  37.14 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0266  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.964939 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2855  hypothetical protein  34.85 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0513  hypothetical protein  34.85 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0164  hypothetical protein  34.85 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1428  hypothetical protein  34.85 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6167  hypothetical protein  39.39 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.087743  normal  0.0288472 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3192  hypothetical protein  34.85 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1466  hypothetical protein  46.15 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.478313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7067  hypothetical protein  39.39 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368637  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6561  hypothetical protein  39.39 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0431  hypothetical protein  34.85 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1270  hypothetical protein  39.39 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0495  hypothetical protein  34.85 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3006  hypothetical protein  49.23 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.761715  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0678  hypothetical protein  34.85 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321937  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0550  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0282  hypothetical protein  34.85 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1935  hypothetical protein  37.1 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.452225  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2854  putative transmembrane protein  37.14 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.23375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0297  hypothetical protein  45 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0146  hypothetical protein  38.98 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6263  hypothetical protein  34.85 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.461612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3531  putative transmembrane protein  35.71 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6549  hypothetical protein  34.85 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0883  putative transmembrane protein  32.35 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>