44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6263 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6263  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461612 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6549  hypothetical protein  97.14 
 
 
70 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6561  hypothetical protein  88.57 
 
 
70 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6167  hypothetical protein  88.57 
 
 
70 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.087743  normal  0.0288472 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1270  hypothetical protein  88.57 
 
 
70 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7067  hypothetical protein  88.57 
 
 
70 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368637  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0282  hypothetical protein  65.15 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0550  hypothetical protein  62.12 
 
 
69 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4166  hypothetical protein  62.12 
 
 
69 aa  90.1  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0678  hypothetical protein  65.15 
 
 
161 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321937  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6171  hypothetical protein  66.67 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0431  hypothetical protein  65.15 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1428  hypothetical protein  65.15 
 
 
83 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0164  hypothetical protein  65.15 
 
 
83 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0495  hypothetical protein  65.15 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0513  hypothetical protein  65.15 
 
 
83 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2855  hypothetical protein  65.15 
 
 
83 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777387  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3192  hypothetical protein  65.15 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0462  hypothetical protein  66.67 
 
 
69 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0808424  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2841  hypothetical protein  65.15 
 
 
69 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.353606  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2852  hypothetical protein  65.15 
 
 
69 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13457  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2758  hypothetical protein  65.15 
 
 
69 aa  87.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996183  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0368  hypothetical protein  54.55 
 
 
69 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2854  putative transmembrane protein  56.34 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.23375  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3531  putative transmembrane protein  54.93 
 
 
77 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185259  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0224  putative transmembrane protein  51.52 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.508917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1250  putative transmembrane protein  50 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342976  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0243  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0138719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0883  putative transmembrane protein  45.71 
 
 
73 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0266  hypothetical protein  54.24 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.964939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4386  putative transmembrane protein  44.29 
 
 
73 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1384  putative transmembrane protein  46.38 
 
 
78 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.074752  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0319  transmembrane protein  51.61 
 
 
69 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1640  hypothetical protein  47.69 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0343284  normal  0.981714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1685  hypothetical protein  47.83 
 
 
73 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.386414  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1935  hypothetical protein  44.62 
 
 
70 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.452225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3824  hypothetical protein  62.16 
 
 
37 aa  53.5  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.620418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1680  putative transmembrane protein  44.44 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0451  hypothetical protein  40 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0475  hypothetical protein  40 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0315  hypothetical protein  33.33 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.172325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1466  hypothetical protein  48.98 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.478313  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04024  hypothetical protein  34.85 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0188  putative transmembrane protein  40.98 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>