41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1645 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1645  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  636    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4082  hypothetical protein  99.03 
 
 		 309 aa  628  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.086292  normal  0.0251599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1179  hypothetical protein  35.41 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1991  bacteriophage protein  33.55 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0367109  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1424  phage protein  33.55 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0748  hypothetical protein  28.42 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.199335  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0917  hypothetical protein  31.56 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2115  hypothetical protein  32.13 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0742947  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1822  bacteriophage protein  31.91 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0287407  normal  0.370598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3460  bacteriophage protein  31.68 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3169  phage protein  31.05 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199001  normal  0.0261445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2477  hypothetical protein  30.54 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883533  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3712  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  30.79 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1142  hypothetical protein  30.2 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147655  normal  0.84612 
 
 
-
 
NC_004310  BR0599  hypothetical protein  29.43 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100982  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0795  hypothetical protein  31.58 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1087  hypothetical protein  29.67 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0412528  normal  0.0298514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2487  hypothetical protein  29.15 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7314  hypothetical protein  29.17 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2601  hypothetical protein  30.35 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1070  phage protein  28.86 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1351  hypothetical protein  29.84 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6572  hypothetical protein  28.85 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2010  hypothetical protein  28.85 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.963888  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0272  phage protein  26.58 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4978  Beta tubulin, autoregulation binding site  27.51 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1694  hypothetical protein  29.08 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.501295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4294  hypothetical protein  28.98 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4192  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1420  hypothetical protein  29.08 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0835  hypothetical protein  22.33 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.794206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1644  phage protein  27.18 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1416  hypothetical protein  28.25 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.0498255 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0254  hypothetical protein  21.55 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.121128  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2889  phage protein  26.77 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0194233  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7156  hypothetical protein  33.14 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2165  hypothetical protein  26.37 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1991  phage protein  28.46 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000642219  normal  0.0137589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3130  phage protein  27.64 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5970  hypothetical protein  28.08 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.630927  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3903  hypothetical protein  29.33 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.627061  normal  0.117585 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0931  hypothetical protein  28.81 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.258225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>