45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2889 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2889  phage protein  100 
 
 		 272 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0194233  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1070  phage protein  52.99 
 
 		 292 aa  279  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1087  hypothetical protein  55.85 
 
 		 294 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0412528  normal  0.0298514 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1644  phage protein  52.99 
 
 		 292 aa  271  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2165  hypothetical protein  52.08 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2477  hypothetical protein  53.93 
 
 		 294 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883533  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1142  hypothetical protein  53.93 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147655  normal  0.84612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1179  hypothetical protein  46.42 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1424  phage protein  44.91 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1991  bacteriophage protein  46.64 
 
 		 307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0367109  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3460  bacteriophage protein  47.76 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0917  hypothetical protein  45.19 
 
 		 288 aa  209  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2115  hypothetical protein  45.52 
 
 		 303 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0742947  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1822  bacteriophage protein  45.52 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0287407  normal  0.370598 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0272  phage protein  40.91 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0795  hypothetical protein  41.73 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1351  hypothetical protein  41.06 
 
 		 296 aa  188  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3169  phage protein  42.16 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199001  normal  0.0261445 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1416  hypothetical protein  42.75 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.0498255 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3712  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  41.35 
 
 		 294 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1694  hypothetical protein  42.38 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.501295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1420  hypothetical protein  42.75 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4294  hypothetical protein  38.81 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2010  hypothetical protein  39.1 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.963888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6572  hypothetical protein  39.1 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4978  Beta tubulin, autoregulation binding site  42.05 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412086 
 
 
-
 
NC_004310  BR0599  hypothetical protein  39.06 
 
 		 291 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7314  hypothetical protein  39.1 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2601  hypothetical protein  39.1 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5970  hypothetical protein  39.18 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.630927  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_002978  WD0748  hypothetical protein  32.56 
 
 		 268 aa  148  7e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.199335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1991  phage protein  39.02 
 
 		 277 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000642219  normal  0.0137589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3130  phage protein  33.21 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71387  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2487  hypothetical protein  31.67 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0835  hypothetical protein  22.09 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.794206  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7156  hypothetical protein  35.81 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0931  hypothetical protein  42.86 
 
 		 222 aa  96.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.258225 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0254  hypothetical protein  23.28 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.121128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3903  hypothetical protein  38.51 
 
 		 216 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.627061  normal  0.117585 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3056  hypothetical protein  27.14 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2726  hypothetical protein  26.81 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000479777  normal  0.0230175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1645  hypothetical protein  26.77 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4082  hypothetical protein  26.77 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.086292  normal  0.0251599 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1314  putative phage associated protein  26.29 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1080  hypothetical protein  24.14 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>