45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1351 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1351  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3169  phage protein  47.8 
 
 		 296 aa  275  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199001  normal  0.0261445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0917  hypothetical protein  44.6 
 
 		 288 aa  251  8.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0795  hypothetical protein  44.33 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1424  phage protein  43.97 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1179  hypothetical protein  43.97 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1694  hypothetical protein  44.11 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.501295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3460  bacteriophage protein  43.97 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1822  bacteriophage protein  44.68 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0287407  normal  0.370598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2115  hypothetical protein  43.05 
 
 		 303 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0742947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1420  hypothetical protein  44.11 
 
 		 297 aa  235  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1991  bacteriophage protein  43.97 
 
 		 307 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0367109  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_004310  BR0599  hypothetical protein  42.52 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4978  Beta tubulin, autoregulation binding site  43.1 
 
 		 291 aa  228  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0272  phage protein  41.5 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1416  hypothetical protein  42.09 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.0498255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4294  hypothetical protein  41.16 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4192  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1087  hypothetical protein  41.18 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0412528  normal  0.0298514 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2165  hypothetical protein  41.16 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3712  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  41.41 
 
 		 294 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2601  hypothetical protein  40.48 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6572  hypothetical protein  40.48 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2010  hypothetical protein  40.48 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.963888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7314  hypothetical protein  40.14 
 
 		 294 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1142  hypothetical protein  40 
 
 		 294 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147655  normal  0.84612 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2477  hypothetical protein  39.66 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5970  hypothetical protein  40.88 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.630927  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1070  phage protein  40.28 
 
 		 292 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1644  phage protein  38.52 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2889  phage protein  41.06 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0194233  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1991  phage protein  35.61 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000642219  normal  0.0137589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2487  hypothetical protein  35.31 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0748  hypothetical protein  32.13 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.199335  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3130  phage protein  33.83 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71387  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0835  hypothetical protein  26.16 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.794206  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7156  hypothetical protein  41.82 
 
 		 362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3903  hypothetical protein  44.17 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.627061  normal  0.117585 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0254  hypothetical protein  24.36 
 
 		 269 aa  116  5e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.121128  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0931  hypothetical protein  41.42 
 
 		 222 aa  116  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.258225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2726  hypothetical protein  30.39 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000479777  normal  0.0230175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3056  hypothetical protein  29.33 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4082  hypothetical protein  30.03 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.086292  normal  0.0251599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1645  hypothetical protein  29.84 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1314  putative phage associated protein  29.05 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0286  hypothetical protein  37.74 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>