43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7156 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7156  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  739    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0917  hypothetical protein  31.59 
 
 
288 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1822  bacteriophage protein  31.77 
 
 
296 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0287407  normal  0.370598 
 
 
-
 
NC_002978  WD0748  hypothetical protein  35.29 
 
 
268 aa  147  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.199335  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1424  phage protein  37.02 
 
 
298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0795  hypothetical protein  40.36 
 
 
295 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1179  hypothetical protein  35.91 
 
 
297 aa  126  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335726  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1351  hypothetical protein  41.82 
 
 
296 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0272  phage protein  36.99 
 
 
294 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3712  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  36.99 
 
 
294 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1087  hypothetical protein  40 
 
 
294 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0412528  normal  0.0298514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2115  hypothetical protein  37.35 
 
 
303 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0742947  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2477  hypothetical protein  37.72 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883533  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1142  hypothetical protein  37.35 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147655  normal  0.84612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1991  bacteriophage protein  35.91 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0367109  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2165  hypothetical protein  34.73 
 
 
296 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3460  bacteriophage protein  36.97 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3169  phage protein  39.39 
 
 
296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199001  normal  0.0261445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2487  hypothetical protein  36.22 
 
 
292 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6572  hypothetical protein  38.15 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2010  hypothetical protein  38.15 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.963888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4294  hypothetical protein  36.99 
 
 
294 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4192  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1070  phage protein  35.48 
 
 
292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7314  hypothetical protein  37.57 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2601  hypothetical protein  36.42 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2889  phage protein  35.81 
 
 
272 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0194233  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1644  phage protein  36.77 
 
 
292 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4978  Beta tubulin, autoregulation binding site  32.77 
 
 
291 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1420  hypothetical protein  33.53 
 
 
297 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1416  hypothetical protein  32.94 
 
 
297 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.0498255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5970  hypothetical protein  35.75 
 
 
297 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.630927  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1991  phage protein  31.01 
 
 
277 aa  99  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000642219  normal  0.0137589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1694  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.501295 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0835  hypothetical protein  26.52 
 
 
271 aa  97.1  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.794206  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3903  hypothetical protein  32.37 
 
 
216 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.627061  normal  0.117585 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0931  hypothetical protein  31.71 
 
 
222 aa  90.9  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.258225 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0254  hypothetical protein  27.68 
 
 
269 aa  90.5  4e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.121128  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0599  hypothetical protein  31.1 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100982  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3130  phage protein  27.59 
 
 
273 aa  77  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71387  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3056  hypothetical protein  37.76 
 
 
288 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2726  hypothetical protein  41.38 
 
 
288 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000479777  normal  0.0230175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4082  hypothetical protein  32.93 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.086292  normal  0.0251599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1645  hypothetical protein  33.14 
 
 
310 aa  63.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295696  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>