15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0137 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0137  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.586109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4669  hypothetical protein  48 
 
 
83 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.567089  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1416  hypothetical protein  43.42 
 
 
83 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1225  CopG domain protein DNA-binding domain protein  37.84 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2632  hypothetical protein  39.51 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84931  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0104  hypothetical protein  39.74 
 
 
86 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0249289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3868  hypothetical protein  34.25 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1311  hypothetical protein  33.78 
 
 
78 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0545  hypothetical protein  32.88 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0450594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0619  hypothetical protein  38.46 
 
 
84 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0267  hypothetical protein  36.23 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1960  hypothetical protein  41.18 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.694381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2306  hypothetical protein  22.54 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000187418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0962  response regulator receiver  42.22 
 
 
169 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0882879  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  41.46 
 
 
130 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>