14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0545 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0545  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  159  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0450594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1311  hypothetical protein  44.87 
 
 
78 aa  85.9  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1225  CopG domain protein DNA-binding domain protein  48.72 
 
 
78 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4600  CopG/DNA-binding domain-containing protein  52.56 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0520995  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1960  hypothetical protein  45.9 
 
 
63 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.694381  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0267  hypothetical protein  33.33 
 
 
78 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3868  hypothetical protein  38.16 
 
 
78 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2306  hypothetical protein  26.67 
 
 
77 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000187418 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0104  hypothetical protein  35.14 
 
 
86 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0249289 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0137  hypothetical protein  32.88 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.586109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0619  hypothetical protein  35.14 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1416  hypothetical protein  42.19 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2632  hypothetical protein  36.67 
 
 
84 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84931  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4669  hypothetical protein  40.74 
 
 
83 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.567089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>