13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0104 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0104  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  173  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0249289 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0619  hypothetical protein  83.33 
 
 		 84 aa  147  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2632  hypothetical protein  61.54 
 
 		 84 aa  93.6  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1311  hypothetical protein  39.71 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1225  CopG domain protein DNA-binding domain protein  39.19 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0137  hypothetical protein  39.74 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.586109 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0545  hypothetical protein  35.14 
 
 		 78 aa  50.1  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0450594  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4669  hypothetical protein  38.55 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.567089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0267  hypothetical protein  33.82 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3868  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4600  CopG/DNA-binding domain-containing protein  39.19 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0520995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1960  hypothetical protein  32.73 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.694381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1416  hypothetical protein  34.94 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>