15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1225 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1225  CopG domain protein DNA-binding domain protein  100 
 
 		 78 aa  156  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1311  hypothetical protein  76.92 
 
 		 78 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0545  hypothetical protein  48.72 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0450594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0267  hypothetical protein  48.72 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3868  hypothetical protein  51.32 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4600  CopG/DNA-binding domain-containing protein  48.72 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0520995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1960  hypothetical protein  49.18 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.694381  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0104  hypothetical protein  39.19 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0249289 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0619  hypothetical protein  41.89 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0137  hypothetical protein  37.84 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.586109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2306  hypothetical protein  32 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000187418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1416  hypothetical protein  39.44 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4669  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.567089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2632  hypothetical protein  38.33 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4197  hypothetical protein  35.94 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>