13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1416 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1416  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  167  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4669  hypothetical protein  81.71 
 
 		 83 aa  131  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.567089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0137  hypothetical protein  43.42 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.586109 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0267  hypothetical protein  41.67 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1311  hypothetical protein  39.44 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3868  hypothetical protein  37.66 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1225  CopG domain protein DNA-binding domain protein  39.44 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2632  hypothetical protein  35.71 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1960  hypothetical protein  35.09 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.694381  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0545  hypothetical protein  42.19 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0450594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4600  CopG/DNA-binding domain-containing protein  45.07 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0520995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0619  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0104  hypothetical protein  34.94 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0249289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>