14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4600 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4600  CopG/DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 
79 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0520995  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0545  hypothetical protein  52.56 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0450594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1311  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1225  CopG domain protein DNA-binding domain protein  48.72 
 
 
78 aa  84  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0267  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2306  hypothetical protein  39.47 
 
 
77 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000187418 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1960  hypothetical protein  50 
 
 
63 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.694381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3868  hypothetical protein  41.67 
 
 
78 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1416  hypothetical protein  44.3 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0619  hypothetical protein  40.54 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0104  hypothetical protein  39.19 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0249289 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4669  hypothetical protein  42.31 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.567089  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0137  hypothetical protein  38.36 
 
 
96 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.586109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2632  hypothetical protein  39.22 
 
 
84 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>