26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2106 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2106  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  298  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0159843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0158  protein of unknown function DUF327  50.67 
 
 
155 aa  160  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3914  hypothetical protein  37.32 
 
 
146 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0514  protein of unknown function DUF327  36.36 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3232  protein of unknown function DUF327  37.86 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0055  hypothetical protein  32.54 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.449218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0041  hypothetical protein  26.72 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.255674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4202  protein of unknown function DUF327  27.97 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00741832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15530  hypothetical protein  33.6 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3667  hypothetical protein  26.28 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000021355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3035  protein of unknown function DUF327  32.97 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0450  hypothetical protein  32.08 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0035  protein of unknown function DUF327  29.59 
 
 
153 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1183  hypothetical protein  28.29 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0160  protein of unknown function DUF327  34.38 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664478  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0659  protein of unknown function DUF327  28.29 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3709700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0646  hypothetical protein  27.63 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000332028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2250  protein of unknown function DUF327  30 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.722735  hitchhiker  0.00505193 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1145  hypothetical protein  27.78 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1683  hypothetical protein  26.09 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0112  hypothetical protein  26.67 
 
 
186 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0708  hypothetical protein  25.81 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1375  hypothetical protein  24.78 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00361251  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1942  hypothetical protein  25.96 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00412294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1618  hypothetical protein  22.86 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.26552  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1553  hypothetical protein  26.35 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.469653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>