19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0450 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0450  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  294  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2250  protein of unknown function DUF327  42.61 
 
 
140 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.722735  hitchhiker  0.00505193 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1183  hypothetical protein  28.95 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0303  hypothetical protein  28.08 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.993336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3232  protein of unknown function DUF327  30.51 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1145  hypothetical protein  29.84 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3914  hypothetical protein  27.54 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2106  hypothetical protein  32.08 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0159843  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1942  hypothetical protein  27.62 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00412294  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0835  hypothetical protein  29.91 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0158  protein of unknown function DUF327  28.1 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3035  protein of unknown function DUF327  29.66 
 
 
145 aa  53.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4202  protein of unknown function DUF327  20.41 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00741832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0035  protein of unknown function DUF327  27.93 
 
 
153 aa  50.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0041  hypothetical protein  25.24 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.255674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3667  hypothetical protein  24.83 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000021355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0514  protein of unknown function DUF327  27.41 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0055  hypothetical protein  26.27 
 
 
146 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.449218  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0160  protein of unknown function DUF327  27.35 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>