28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3914 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3914  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  293  8e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0158  protein of unknown function DUF327  43.44 
 
 
155 aa  111  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2106  hypothetical protein  37.32 
 
 
150 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0159843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0514  protein of unknown function DUF327  29.17 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3232  protein of unknown function DUF327  29.69 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0055  hypothetical protein  28.67 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.449218  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0035  protein of unknown function DUF327  32.17 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4202  protein of unknown function DUF327  32.26 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00741832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15530  hypothetical protein  30.23 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3035  protein of unknown function DUF327  27.78 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0450  hypothetical protein  27.54 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1183  hypothetical protein  27.59 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0041  hypothetical protein  25.44 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.255674  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1145  hypothetical protein  26.72 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3667  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000021355  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1019  protein of unknown function DUF327  36 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.2771  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1375  hypothetical protein  29.84 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00361251  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0835  hypothetical protein  27.35 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1942  hypothetical protein  32.38 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00412294  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0112  hypothetical protein  26.36 
 
 
186 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0160  protein of unknown function DUF327  27.18 
 
 
155 aa  47  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2250  protein of unknown function DUF327  29.91 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.722735  hitchhiker  0.00505193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1683  hypothetical protein  28.57 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0646  hypothetical protein  30.48 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000332028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0659  protein of unknown function DUF327  29.52 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3709700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1618  hypothetical protein  29.09 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.26552  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0708  hypothetical protein  25.51 
 
 
148 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127002  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0303  hypothetical protein  24.59 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.993336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>