18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1618 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1618  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  304  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.26552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1683  hypothetical protein  69.13 
 
 		 149 aa  209  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3667  hypothetical protein  54 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000021355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1375  hypothetical protein  46.71 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00361251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0646  hypothetical protein  48 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000332028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0659  protein of unknown function DUF327  47.33 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3709700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0708  hypothetical protein  44.54 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127002  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0160  protein of unknown function DUF327  36.59 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664478  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0303  hypothetical protein  28.32 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.993336  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1183  hypothetical protein  25.71 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3914  hypothetical protein  29.09 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1145  hypothetical protein  25.93 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0158  protein of unknown function DUF327  24.63 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0041  hypothetical protein  21.9 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.255674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1942  hypothetical protein  25.69 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00412294  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0835  hypothetical protein  24.75 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2106  hypothetical protein  22.86 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0159843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0514  protein of unknown function DUF327  27.87 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>