18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1683 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1683  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  299  8.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1618  hypothetical protein  69.13 
 
 		 151 aa  209  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.26552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3667  hypothetical protein  48.65 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000021355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1375  hypothetical protein  47.65 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00361251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0659  protein of unknown function DUF327  45.95 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3709700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0646  hypothetical protein  46.62 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000332028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0708  hypothetical protein  43.24 
 
 		 148 aa  123  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127002  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0160  protein of unknown function DUF327  40.98 
 
 		 155 aa  97.8  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664478  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1942  hypothetical protein  30.1 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00412294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2106  hypothetical protein  26.09 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0159843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0158  protein of unknown function DUF327  27.43 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0514  protein of unknown function DUF327  26.17 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3914  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0303  hypothetical protein  28.95 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.993336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0041  hypothetical protein  26.83 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.255674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 639 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0835  hypothetical protein  26.26 
 
 		 154 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0112  hypothetical protein  27.45 
 
 		 186 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>