21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1183 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1183  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  300  7.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1145  hypothetical protein  94.74 
 
 
152 aa  266  5.9999999999999995e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0835  hypothetical protein  56.78 
 
 
154 aa  140  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0303  hypothetical protein  42.48 
 
 
153 aa  135  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.993336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1942  hypothetical protein  41.67 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00412294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0035  protein of unknown function DUF327  31.17 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0450  hypothetical protein  28.95 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3232  protein of unknown function DUF327  29.66 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3035  protein of unknown function DUF327  35.16 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3914  hypothetical protein  27.59 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2106  hypothetical protein  28.29 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0159843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15530  hypothetical protein  28.29 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0112  hypothetical protein  25.93 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0158  protein of unknown function DUF327  24.58 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2250  protein of unknown function DUF327  30.63 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.722735  hitchhiker  0.00505193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1618  hypothetical protein  25.71 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.26552  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3667  hypothetical protein  25.83 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000021355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0514  protein of unknown function DUF327  26.15 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0055  hypothetical protein  27.5 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.449218  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0160  protein of unknown function DUF327  27.73 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4202  protein of unknown function DUF327  23.53 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00741832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>