More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6411 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6411  inositol monophosphatase  100 
 
 
274 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3772  inositol monophosphatase  33.98 
 
 
264 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.017252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  41.85 
 
 
263 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.2 
 
 
273 aa  136  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3755  inositol monophosphatase  34.45 
 
 
269 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0581118  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  35.84 
 
 
353 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2324  inositol-phosphate phosphatase  38.57 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18323  predicted protein  35.36 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7280  inositol monophosphatase  39.89 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0255139  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  32.69 
 
 
300 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1698  inositol monophosphatase  35.02 
 
 
261 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.133457  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2169  inositol monophosphatase family protein  41.08 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0841  inositol monophosphatase  41.08 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00388  inositol-1-monophosphatase  42.08 
 
 
277 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25186  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  39.08 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6007  inositol-phosphate phosphatase  40.44 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601575 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0963  Inositol-phosphate phosphatase  41.29 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.220962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1045  inositol-phosphate phosphatase  41.29 
 
 
347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0806171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  42.77 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2665  inositol-phosphate phosphatase  38.74 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.887492  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  42.2 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  42.77 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  39.78 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2747  Inositol-phosphate phosphatase  33.46 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4248  inositol-phosphate phosphatase  36.82 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0646891  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  43.67 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  42.2 
 
 
272 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  42.2 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  41.62 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  41.71 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1232  inositol-1(or 4)-monophosphatase  34.17 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.223718  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0707  inositol monophosphatase  36.7 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  32.94 
 
 
270 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  40.94 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  34.73 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  40.94 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  38.94 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  40 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  31.27 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  32.55 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1199  inositol-phosphate phosphatase  39.43 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.339227 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  36.41 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  40.35 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1078  inositol monophosphatase  40.35 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.701332  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0412  inositol-phosphate phosphatase  38.73 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  39.08 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  32.54 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  42.2 
 
 
271 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  39.31 
 
 
263 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  32.43 
 
 
263 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  42.2 
 
 
271 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1115  inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.6 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2935  inositol monophosphatase  34.87 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.932789  normal  0.110329 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1636  extragenic supressor  40.78 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1579  inositol-phosphate phosphatase  40.78 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0271512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  40 
 
 
268 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  34.12 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  34.12 
 
 
267 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  34.12 
 
 
267 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  34.12 
 
 
267 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  34.12 
 
 
267 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  41.24 
 
 
263 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2070  inositol monophosphatase  39.35 
 
 
313 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  38.73 
 
 
266 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  33.73 
 
 
267 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  33.73 
 
 
267 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  33.73 
 
 
267 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  41.62 
 
 
271 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  33.73 
 
 
267 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  33.73 
 
 
267 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0385  Inositol-phosphate phosphatase  41.4 
 
 
272 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391446  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  33.73 
 
 
267 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  33.73 
 
 
267 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  41.24 
 
 
263 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  33.73 
 
 
267 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  37.14 
 
 
265 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  33.73 
 
 
267 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3055  inositol-phosphate phosphatase  38.73 
 
 
262 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00295141  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  41.36 
 
 
270 aa  123  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2740  inositol monophosphatase  36.52 
 
 
263 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0333138  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3507  inositol-phosphate phosphatase  38.2 
 
 
265 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.991426  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.71 
 
 
328 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  32.94 
 
 
267 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  40.68 
 
 
263 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2439  inositol-1-monophosphatase  38.54 
 
 
315 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  31.88 
 
 
267 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  31.88 
 
 
267 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3630  inositol monophosphatase  32.55 
 
 
267 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0471893  normal  0.858784 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  31.88 
 
 
267 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  33.33 
 
 
255 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1028  inositol-1(or 4)-monophosphatase  34.7 
 
 
264 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  32.54 
 
 
267 aa  122  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  32.16 
 
 
267 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3537  inositol-1(or 4)-monophosphatase  34.16 
 
 
263 aa  122  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0246  inositol-1(or 4)-monophosphatase  32.56 
 
 
275 aa  122  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  32.54 
 
 
267 aa  122  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  37.11 
 
 
267 aa  122  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  37.63 
 
 
266 aa  121  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0333  inositol-phosphate phosphatase  39.88 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.366405  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1050  Inositol-phosphate phosphatase  40 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>