24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2370 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2370  acyltransferase 3  100 
 
 
335 aa  674    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2405  acyltransferase 3  27.74 
 
 
338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119341  normal  0.235753 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2204  acyltransferase 3  28.33 
 
 
352 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.517072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3644  acyltransferase 3  30.88 
 
 
344 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000222847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0199  acyltransferase family protein  25.86 
 
 
352 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000876664  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0199  acyltransferase  25.57 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00737007  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2419  acyltransferase 3  23.67 
 
 
342 aa  63.2  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.897127  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1534  GumF protein  27.55 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.274093  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1544  acyltransferase 3  23.68 
 
 
387 aa  59.3  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2999  hypothetical protein  24.43 
 
 
355 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1478  acyltransferase 3  27.86 
 
 
363 aa  56.2  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.120403  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2441  acyltransferase 3  29.09 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35600  hypothetical protein  23.2 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110812  hitchhiker  0.00000141946 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1109  acyltransferase 3  25 
 
 
336 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00931964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1132  acyltransferase 3  25 
 
 
336 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128492  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2655  acyltransferase 3  36.05 
 
 
361 aa  49.7  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0104149  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01397  exopolysaccharide xanthan biosynthesis acetyltransferase GumG  34.34 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3072  acyltransferase 3  24.68 
 
 
351 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01396  exopolysaccharide xanthan biosynthesis acetyltransferase GumF  35.29 
 
 
363 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0850077  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1520  acyltransferase 3  25.13 
 
 
331 aa  47  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0999  acyltransferase 3  25.67 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0634  hypothetical protein  37.04 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0434683  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05570  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  22.56 
 
 
355 aa  42.7  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  33.33 
 
 
394 aa  42.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>