126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2116 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2116  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
120 aa  246  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2191  lactoylglutathione lyase  27.64 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2046  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.33743e-17 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2450  lactoylglutathione lyase  29.69 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00862071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3783  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.47 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.553638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1979  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.14 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1478  lactoylglutathione lyase  27.78 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0459895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2200  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.4 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.335588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0971  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.95 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380458  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1491  glyoxalase I/lactoylglutathione lyase  27.87 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  26.19 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4285  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.89 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  29.13 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3357  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.32 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  27.78 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5010  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.32 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001198  glyoxylase family protein  26.89 
 
 
127 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4246  lactoylglutathione lyase  30.71 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000558126  hitchhiker  0.000000049378 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3632  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.42 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02739  glyoxalase I, nickel isomerase (Lactoylglutathione lyase)  27.5 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.206063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2177  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
126 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.66024  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  28.12 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0012737  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4804  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.83 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.114931  normal  0.177904 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1716  glyoxalase family protein  26.32 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000150702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  28.46 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  29.37 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.32 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  28.12 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  29.17 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  28.12 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  28.12 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  28.12 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  28.12 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  28.12 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  28.12 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  28.35 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4259  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.62 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.925226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2915  lactoylglutathione lyase  25.76 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.401625 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  29.37 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4654  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.83 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4171  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.66 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1643  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.93 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.201281 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  28.12 
 
 
238 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  24.24 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  29.37 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.78 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808514  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  29.41 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1402  lactoylglutathione lyase  25 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1043  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0056  glyoxalase family protein  27.5 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.471593  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  28.68 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  28.68 
 
 
129 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0681  lactoylglutathione lyase  26.19 
 
 
128 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.553347  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2825  glyoxylase family protein  24.79 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.090794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0056  glyoxalase family protein  27.5 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2649  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.09 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000551252  normal  0.306748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  27.34 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0933  lactoylglutathione lyase  27.34 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  25.37 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7090  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.81 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4287  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.17 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3368  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.17 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.278611  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.2 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.107987 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  24.63 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  26.92 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3047  glyoxalase family protein  29.06 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144066  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  26.77 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0660  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.52 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  25.6 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2201  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.24 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002900  lactoylglutathione lyase  25.21 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.796352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0453  glyoxalase family protein  23.73 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  27.78 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  27.78 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3736  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.56 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2070  hypothetical protein  24.17 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765991  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0411  lactoylglutathione lyase  24.03 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208299  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3046  glyoxalase family protein  29.06 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2291  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.66 
 
 
127 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1795  glyoxalase I  24.81 
 
 
135 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118408  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.66 
 
 
127 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.422814  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1866  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.78 
 
 
123 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3843  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.78 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.21 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  25.78 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  23.66 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1035  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.97 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1549  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.92 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  27.13 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0685  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.97 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.858158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.44 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000115728  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  26.98 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.57 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.029939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  26.56 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3818  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.26 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.475756 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4478  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.59 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.613578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  24.03 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.58 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.859727 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>