15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1403 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1403  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
323 aa  659    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0369  hypothetical protein  24.92 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.415147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0872  hypothetical protein  23.66 
 
 
414 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  22.31 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  21.18 
 
 
346 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  20.87 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  22.11 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  27.66 
 
 
1032 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  24.2 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.18 
 
 
369 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  24.11 
 
 
1147 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  22.37 
 
 
336 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  22.37 
 
 
336 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  26.39 
 
 
324 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  22.8 
 
 
329 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>