16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0989 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0989  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  323  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00450031  hitchhiker  0.000444366 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0663  hypothetical protein  42.04 
 
 
157 aa  136  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1211  hypothetical protein  38.79 
 
 
177 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0202037  normal  0.640858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0995  hypothetical protein  40.24 
 
 
182 aa  123  9e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.606153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0046  hypothetical protein  37.34 
 
 
158 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1290  hypothetical protein  39.26 
 
 
184 aa  121  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0064  hypothetical protein  33.95 
 
 
162 aa  121  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0823  hypothetical protein  36.02 
 
 
161 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.324889  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0441  hypothetical protein  37.04 
 
 
176 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.346927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0441  hypothetical protein  32.56 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2216  hypothetical protein  30.49 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3676  hypothetical protein  36.59 
 
 
164 aa  60.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0958587 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1024  hypothetical protein  25.97 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170682  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0534  hypothetical protein  28.39 
 
 
175 aa  54.3  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2873  hypothetical protein  30.43 
 
 
238 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0739546  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1267  hypothetical protein  23.6 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.793977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>