17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3676 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3676  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  321  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0958587 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0663  hypothetical protein  26.75 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0064  hypothetical protein  28.4 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0046  hypothetical protein  28.29 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1290  hypothetical protein  29.17 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0989  hypothetical protein  28.03 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00450031  hitchhiker  0.000444366 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1211  hypothetical protein  28.14 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0202037  normal  0.640858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0995  hypothetical protein  27.17 
 
 
182 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.606153  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0823  hypothetical protein  26.54 
 
 
161 aa  60.8  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.324889  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0441  hypothetical protein  26.92 
 
 
176 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.346927  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1267  hypothetical protein  23.57 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.793977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2216  hypothetical protein  30.43 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0441  hypothetical protein  36.49 
 
 
155 aa  48.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0534  hypothetical protein  28.4 
 
 
175 aa  47.4  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1187  hypothetical protein  26.59 
 
 
323 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1024  hypothetical protein  28.05 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170682  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1842  hypothetical protein  37.88 
 
 
100 aa  40.8  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0603904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>