13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0534 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0534  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  343  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0441  hypothetical protein  29.87 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.346927  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1211  hypothetical protein  27.11 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0202037  normal  0.640858 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0064  hypothetical protein  28.76 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0989  hypothetical protein  28.39 
 
 		 161 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00450031  hitchhiker  0.000444366 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0663  hypothetical protein  26.49 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2216  hypothetical protein  31.37 
 
 		 172 aa  51.2  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0046  hypothetical protein  27.78 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0823  hypothetical protein  23.84 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.324889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1290  hypothetical protein  27.27 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0441  hypothetical protein  26.6 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3676  hypothetical protein  26.62 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0958587 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2873  hypothetical protein  25.81 
 
 		 238 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0739546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>