16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1290 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1290  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  364  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0995  hypothetical protein  59.34 
 
 		 182 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.606153  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0441  hypothetical protein  52.75 
 
 		 176 aa  192  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.346927  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1211  hypothetical protein  51.15 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0202037  normal  0.640858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0663  hypothetical protein  44.79 
 
 		 157 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0064  hypothetical protein  42.94 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0989  hypothetical protein  40.36 
 
 		 161 aa  131  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00450031  hitchhiker  0.000444366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0823  hypothetical protein  36.42 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.324889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0046  hypothetical protein  41.25 
 
 		 158 aa  119  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3676  hypothetical protein  29.17 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0958587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0534  hypothetical protein  27.1 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0441  hypothetical protein  25.93 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2216  hypothetical protein  26.14 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1024  hypothetical protein  24.39 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170682  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1842  hypothetical protein  27.37 
 
 		 100 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0603904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1323  hypothetical protein  30.92 
 
 		 277 aa  42  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>