15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0663 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0663  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  314  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0064  hypothetical protein  60.13 
 
 
162 aa  205  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0823  hypothetical protein  60.9 
 
 
161 aa  199  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.324889  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0046  hypothetical protein  57.59 
 
 
158 aa  185  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0441  hypothetical protein  49.06 
 
 
176 aa  153  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.346927  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1211  hypothetical protein  45.06 
 
 
177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0202037  normal  0.640858 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1290  hypothetical protein  44.79 
 
 
184 aa  141  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0989  hypothetical protein  42.04 
 
 
161 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00450031  hitchhiker  0.000444366 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0995  hypothetical protein  44.24 
 
 
182 aa  134  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.606153  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1024  hypothetical protein  32.19 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0441  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2216  hypothetical protein  29.11 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3676  hypothetical protein  27.49 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0958587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0534  hypothetical protein  26.49 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1267  hypothetical protein  36.07 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.793977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>