14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0995 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0995  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.606153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1290  hypothetical protein  58.96 
 
 		 184 aa  194  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0441  hypothetical protein  52.75 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.346927  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1211  hypothetical protein  50.56 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0202037  normal  0.640858 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0064  hypothetical protein  43.53 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0663  hypothetical protein  44.24 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0989  hypothetical protein  40.24 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00450031  hitchhiker  0.000444366 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0046  hypothetical protein  42.17 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0823  hypothetical protein  37.87 
 
 		 161 aa  121  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.324889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3676  hypothetical protein  27.06 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0958587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2216  hypothetical protein  26.14 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1024  hypothetical protein  25.75 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0441  hypothetical protein  27.1 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1267  hypothetical protein  21.69 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.793977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>